Infecciones respiratorias virales comunitarias en pacientes hospitalizados durante el brote de COVID-19 en Singapur: coinfección y desenlace

Pastilla 1C

¿Cuál es la prevalencia de las infecciones respiratorias comunitarias durante la pandemia de COVID-19 y el riesgo de coinfección por las mismas en pacientes positivos para SARS-CoV-2?

RECOLECCIÓN: Alejandro Batallas
REDACCIÓN:
Paola Carolina Espín Díaz, MD.
EDICIÓN: Emily Betania Granadillo Castro, MD. 
APROBACIÓN:
Antonio Naranjo, MD. Esp. – Medicina Interna

Singhealth Infectious Diseases Residency, Singapore 

19 de mayo de 2020 

  • Estudio realizado en una sola institución. 

  • Pese a que se evalúa el riesgo de coinfección por virus respiratorios comunitarios, solamente se consideraron a pacientes hospitalizados. 

  • Solo el 75% de los 3807 pacientes fueron sometidos a PCR para virus respiratorios comunitarios. 

Pese a encontrarnos en medio de una pandemia por COVID-19, no hay que dejar de considerar a otros virus respiratorios (algunos con terapias antivirales establecidas como es el caso de la influenza) como agente etiológico de infección de vías respiratorias altas o neumonía. Además, la importancia de definir el riesgo de coinfección en pacientes COVID-19 es identificar si ésta se asocia a una mayor tasa de mortalidad y en base a esto establecer medidas de bioseguridad para el manejo de estos pacientes. De igual manera en base a este estudio se puede ratificar la importancia del distanciamiento social durante el brote del virus. 

Durante un brote de coronavirus, una gran proporción de hospitalizaciones son por infecciones virales distintas a COVID-19. El riesgo de coinfección por otros virus respiratorios en pacientes COVID-19 es bajo. Se asocia mayor riesgo de requerir soporte ventilatorio y mayor mortalidad hospitalaria a infecciones por virus respiratorios comunes. La vigilancia continua de otros patógenos respiratorios durante un brote continuo de COVID-19 sigue siendo importante, para identificar la tasa de coinfección. 

Se trata de un estudio transversal realizado en el Hospital General de Singapur en el que se analizaron a 3807 pacientes hospitalizados en la “Sala de Vigilancia Respiratoria” a lo largo de un periodo de 10 semanas, período en el que se había descrito la trasmisión local de SARS-CoV-2.  

Los criterios de ingreso fueron: 

  • Presencia de síntomas respiratorios: tos, rinorrea, disnea y/o 

  • Radiografía de tórax compatible con neumonía. 

 Los siguientes datos fueron recolectados por el Grupo de trabajo de preparación para epidemias/ pandemias del hospital: 

  • Características demográficas  

    • Edad 

    • Etnia 

    • Género 

  • Resultados de laboratorio con sus respectivos puntos de corte 

    • Leucocitosis >10 × 109/L 

    • Leucopenia <4.0 × 109 /L 

    • LDH >245 U/L  

    • Procalcitonina >0.25 ng/ml 

  • Imagen de Tórax: catalogada como neumonía por la presencia de infiltrados más cuadro clínico. 

Dentro de las primeras 24 horas de admisión se recolectaron muestras de hisopado orofaríngeo (en caso de no poder obtener la misma, se recolectaron muestras nasofaríngeas, esputo o lavado broncoalveolar) de todos los pacientes para ser sometidas a RT-PCR cuantitativo dirigido al gen E y ORF1b-nsp14 del SARS-CoV-2.  

 Un 75% de pacientes fueron sometidos paralelamente a PCR Multiplex para virus respiratorios, según sospecha de etiología diferente a SARS-CoV-2. El panel contenía los siguientes virus: 

  • Influenza A and B 

  • Virus parainfluenza humano tipo 1/2/3/4,  

  • Virus sincitial respiratorio subtipos A y B 

  • Metapneumovirus humano 

  • Coronavirus humano tipo 229E/NL63/OC43 

  • Rinovirus tipo A/B/C 

  • Enterovirus 

  • Adenovirus  

  • Bocavirus humanos tipo 1/2/3/4. 

 Se definió la coinfección como la presencia de uno o más virus en las pruebas de PCR. 

Los siguientes desenlaces a considerar fueron: 

  • Necesidad de cuidados intensivos durante la hospitalización, 

  • Duración de la hospitalización (días), 

  • Muerte durante la hospitalización. 

Número: 3807 pacientes con síntomas respiratorios  

Grupos: 736 positivos para virus respiratorio 

  • 431 positivos para SARS-CoV-2 
  • 311 positivos para 1 o más virus respiratorios (incluidos SARS-CoV-2=6) 

Pérdida en el seguimiento: Ninguna 

5 de febrero del 2020 hasta el15 de abril del 2020 

  • 58.5% (431/736) dieron positivo para SARS-CoV-2 y 42.2% (311/736) dieron positivo para 1 o más virus respiratorios. 

  • Los virus más comunes a parte del SARS-CoV-2 fueron: 

    • Rinovirus 41.8%, (130/311),  

    • Influenza 14.4%, (45/311)  

    • Otros coronavirus 10.2% (32/311) 

  • Solo 1.4%, (6/431) de pacientes COVID-19 positivos presentaron coinfección con otros virus respiratorios 

    • 3 rinovirus

    • 2 parainfluenza  

    • 1 otros coronavirus 

  • El 4.8% (15/311) de pacientes positivos para virus respiratorios presentaron co infección con otros virus respiratorios comunes 

  • Probabilidad de coinfección en pacientes COVID positivos fue más baja comparada con el grupo positivo para otros virus respiratorios. OR = 0.27, 95%IC= 0.11–0.72, p<0.001 

  • Las características de los 6 pacientes COVID-19 coinfectados fueron: 

    • Edad: 27-31 años 

    • Todos los individuos vivían en dormitorios compartidos 

    • 5 individuos con compañeros de cuarto COVID-19 positivos 

    • Todos presentaron cuadro clínico de infección de vías respiratorias altas. 

    • Síntomas: Fiebre y tos. 

    • Todos se recuperaron 

  • El 1.2% (5/431) de pacientes COVID-19 positivos requirieron de ventilación mecánica comparado con el 3.53% (11/311) de aquellos infectados por otros virus respiratorios.  (OR = 0.32, 95%CI = 0.11-0.93, p = 0.04). 

  • La tasa de mortalidad para COVID-19 fue 0.23% (1/431) vs el 1.62% (7/311) para pacientes positivos para otros virus respiratorios. (OR = 0.10, 95%CI = 0.01–0.83, p = 0.01). 

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Resultado principal: existe una baja probabilidad de coinfección por otros virus respiratorios en pacientes COVID-19 positivo. 

Resultados secundarios: Existe un mayor riesgo de requerir ventilación mecánica y mayor riesgo de mortalidad hospitalaria en pacientes infectados con virus respiratorios diferentes a COVID-19. 

Pruebas estadísticas utilizadas: Chi cuadrado. 

En L, Ki K, Ko K, Qi W, Teck G, Kwek C, et al. Community-acquired viral respiratory infections amongst hospitalized inpatients during a COVID-19 outbreak in Singapore : co-infection and clinical outcomes. J Clin Virol [Internet]. 2020;128(May):104436. Available from: https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104436 

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