Comparación de muestras de tracto respiratorio superior para detección de SARS-CoV-2

Pastilla 1C

¿Qué tipo de muestra tiene la mayor tasa de resultados positivos para el diagnóstico de SARS-CoV2?

RECOLECCIÓN: GABRIEL PATRICIO VILLAVICENCIO
REDACCIÓN:
MARÍA JOSÉ MALDONADO PINTO
ANDREA ROSMERY ITURRALDE CARRILLO
EDICIÓN: DR. JOSÉ EDUARDO LEÓN-ROJAS , MD. M.Sc.
APROBACIÓN:
DR. LUIS MERLO CHAVES, MD. Mg – EDUACIÓN MÉDICA

Brigham and Women’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, MA, USA

19 de mayo de 2020

09 de junio de 2020

  • La mayoría de los pacientes de quienes se obtuvo las muestras estaban hospitalizados, por lo que los resultados podrían ser distintos en pacientes asintomáticos.

  • La obtención de una muestra de esputo adecuada resulta más difícil, esto puede explicar la menor cantidad de este tipo muestra en los estudios en comparación con muestras naso y orofaríngeas.

  • Los estudios comparados tienen cierto grado de heterogeneidad.

  • El estudio es un preprint que no ha sido certificado por una revisión por pares.

  • No se realiza la evaluación de sesgo de los estudios incluidos en la Revisión Sistemática.

Resultado principal del artículo

La muestra de esputo obtuvo la mayor tasa de resultados positivos en comparación con el hisopado nasofaríngeo y orofaríngeo, que fue la que menos resultados positivos obtuvo.
La positividad de los resultados depende del tiempo que transcurre desde el inicio de los síntomas hasta la fecha de toma de la muestra

Conclusión o recomendación de los autores del artículo

Los resultados del estudio apoyan el uso de la muestra de esputo como el método principal para el diagnóstico y monitoreo de COVID-19. Si no se puede obtener muestra de esputo, el hisopado nasofaríngeo constituye una muestra valiosa.

Calificación de la evidencia según COVID19EC

El GRUPO COVID19EC recomienda que, en la medida de lo posible, la toma de muestra del tracto respiratorio para el diagnóstico sea lo antes posible una vez iniciada la sintomatología. La evidencia apoya la realización de muestras de esputo, de ser posible, en los casos que el paciente tenga la capacidad de generarlo y de que sea una muestra de calidad.

Tipo de estudio y lugar donde se hizo

Revisión sistemática; 11 estudios; bases de datos: Pubmed, MedXriv, BioRxiv. Boston MA, USA.

Duración del estudio

La búsqueda se completó hasta el 30 de abril del 2020

Pacientes

Número

11 estudios, 759 pacientes con diagnóstico de COVID-19, 3442 muestras del tracto respiratorio superior: 1083 muestras de hisopado orofaríngeo, 1299 de hisopado nasofaríngeo y 1060 muestras de esputo.
Se incluyeron estudios que evaluaron al menos dos muestras respiratorias (hisopado nasofaríngeo, orofaríngeo, esputo) en pacientes con COVID-19 confirmado.

Grupos

Resultados positivos totales:

  • Muestra de esputo

  • Hisopado nasofaríngeo

  • Hisopado orofaríngeo

Resultados positivos por examen y por tiempo hasta la toma de la muestra:

  • Muestra de esputo

    • 0-7 días 

    • 8-14 días 

    • >14 días

  • Hisopado nasofaríngeo

    • 0-7 días

    • 8-14 días

    • > 14 días

  • Hisopado orofaríngeo

    • 0-7 días

    • 8-14 días

    • 14 días

Desarrollo del estudio

Se realizó una búsqueda computarizada en las bases de datos Pubmed, MedRxiv y BioRxiv con los términos (COVID o COVID-19 o SARS) y (throat OR nasal OR nasopharyngeal OR oropharyngeal OR saliva OR sputum OR PCR), la búsqueda se completó el 30 de abril del 2020. De los 1039 resultados se eligieron 11 que cumplían los criterios de inclusión.

Se estimaron los porcentajes de los resultados positivos del PCR con un intervalo de confianza del 95%, se realizó un análisis estratificado por la duración de los síntomas antes de la prueba categorizados como 0- 7 días, 8-14 días y >14 días.

Objetivos del estudio

Comparar las muestras respiratorias (esputo, hisopado nasofaríngeo y orofaríngeo) para la detección del SARS-CoV2 

Resultados totales por tipo de muestra:

  • Hisopado orofaríngeo: 43% positivos (IC95% 34-53%)

  • Hisopado nasofaríngeo: 54% positivos (IC95% 41-67%)

  • Esputo: 71% positivos (IC95% 61-80)

Mientras más cerca de la fecha de inicio de los síntomas se realice la prueba, la tasa de detección de casos positivos mejora:

  • Hisopado orofaríngeo: pruebas positivas 75% (IC 95%: 60-88%) entre los días 0-7, 35% (IC 95%: 27-43%) entre los días 8-14 y 12% (IC 95%: 2-25%) después de 14 días desde el inicio de los síntomas.

  • Hisopado nasofaríngeo: casos positivos 80% (IC 95%: 66-91%), 59% (IC 95%: 53-64%) y 36% (IC 95%: 18-57%) a los 0-7 días, 8-14 días y >14 días después del inicio de los síntomas, respectivamente.

  • Esputo: casos positivos 98% (IC 95%: 89-100%), 69% (IC 95%: 57-80%), 46% (IC 95%: 23-70%) a los 0-7 días, 8-14 días y> 14 días después del inicio de los síntomas, respectivamente.

Los porcentajes estimados de las pruebas de qPCR SARS-CoV-2 positivas y los intervalos de confianza para cada estrategia de muestreo se calcularon utilizando Stata Metaprop. Se realizó una prueba Z para comparar los resultados positivos de las pruebas entre las distintas muestras. Se aplicó la transformación de doble arcoseno de Freeman Turkey en estudios con muestras pequeñas y valores de sensibilidad muy altos o bajos y el índice de inconsistencia para evaluar la heterogeneidad de los estudios

Mohammadi A, Esmaeilzadeh E, Li Y, Bosch RJ, Li J. SARS-CoV-2 Detection in Different Respiratory Sites A Systematic Review and Meta-Analysis. Medrxiv [Internet]. 2020;1–20. Available from: http://medrxiv.org/cgi/content/short/2020.05.14.20102038

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Revisa el Protocolo Metodológico de COVID19EC que se encuentra en la página principal 

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